Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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D13Ertd608eQ3UPR8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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D13Ertd608eQ3UPR8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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D13Ertd608eQ3UPR8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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D13Ertd608eQ3UPR8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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D13Ertd608eQ3UPR8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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D13Ertd608eQ3UPR8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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D13Ertd608eQ3UPR8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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D13Ertd608eQ3UPR8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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D13Ertd608eQ3UPR8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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