Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPI1

Fam198b, Protein FAM198B, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam198bQ3UPI1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam198bQ3UPI1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms