Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH1

Prrc1, Protein PRRC1, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc1Q3UPH1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms