Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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Tmem253Q3UNB8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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