Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms