Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sf3b2Q3UJB0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms