Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms