Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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