Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trafd1Q3UDK1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms