Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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