Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf180Q3U827 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf180Q3U827 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf180Q3U827 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf180Q3U827 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf180Q3U827 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf180Q3U827 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf180Q3U827 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf180Q3U827 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf180Q3U827 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf180Q3U827 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf180Q3U827 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf180Q3U827 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf180Q3U827 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf180Q3U827 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf180Q3U827 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf180Q3U827 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf180Q3U827 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf180Q3U827 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf180Q3U827 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf180Q3U827 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf180Q3U827 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf180Q3U827 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf180Q3U827 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf180Q3U827 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf180Q3U827 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf180Q3U827 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf180Q3U827 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf180Q3U827 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf180Q3U827 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf180Q3U827 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf180Q3U827 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf180Q3U827 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf180Q3U827 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf180Q3U827 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf180Q3U827 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf180Q3U827 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf180Q3U827 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf180Q3U827 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf180Q3U827 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rnf180Q3U827 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf180Q3U827 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf180Q3U827 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf180Q3U827 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf180Q3U827 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf180Q3U827 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf180Q3U827 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf180Q3U827 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf180Q3U827 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf180Q3U827 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf180Q3U827 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms