Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

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Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kdm4dQ3U2K5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms