Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K0

Fam193b, Protein FAM193B, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam193bQ3U2K0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam193bQ3U2K0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam193bQ3U2K0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam193bQ3U2K0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam193bQ3U2K0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam193bQ3U2K0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam193bQ3U2K0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fam193bQ3U2K0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fam193bQ3U2K0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fam193bQ3U2K0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fam193bQ3U2K0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam193bQ3U2K0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam193bQ3U2K0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam193bQ3U2K0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam193bQ3U2K0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam193bQ3U2K0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam193bQ3U2K0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam193bQ3U2K0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam193bQ3U2K0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam193bQ3U2K0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam193bQ3U2K0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam193bQ3U2K0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam193bQ3U2K0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam193bQ3U2K0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam193bQ3U2K0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam193bQ3U2K0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam193bQ3U2K0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam193bQ3U2K0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam193bQ3U2K0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam193bQ3U2K0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms