Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vars2Q3U2A8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vars2Q3U2A8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vars2Q3U2A8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vars2Q3U2A8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vars2Q3U2A8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vars2Q3U2A8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Vars2Q3U2A8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vars2Q3U2A8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vars2Q3U2A8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vars2Q3U2A8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vars2Q3U2A8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vars2Q3U2A8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vars2Q3U2A8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vars2Q3U2A8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vars2Q3U2A8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vars2Q3U2A8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vars2Q3U2A8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vars2Q3U2A8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vars2Q3U2A8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vars2Q3U2A8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vars2Q3U2A8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vars2Q3U2A8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vars2Q3U2A8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vars2Q3U2A8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Vars2Q3U2A8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Vars2Q3U2A8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vars2Q3U2A8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vars2Q3U2A8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vars2Q3U2A8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vars2Q3U2A8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Vars2Q3U2A8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vars2Q3U2A8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Vars2Q3U2A8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vars2Q3U2A8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vars2Q3U2A8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vars2Q3U2A8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vars2Q3U2A8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vars2Q3U2A8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vars2Q3U2A8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vars2Q3U2A8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vars2Q3U2A8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vars2Q3U2A8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vars2Q3U2A8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vars2Q3U2A8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms