Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Trappc9Q3U0M1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms