Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0I6

Smim6, MCG148180, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim6Q3U0I6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim6Q3U0I6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim6Q3U0I6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim6Q3U0I6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim6Q3U0I6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smim6Q3U0I6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smim6Q3U0I6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim6Q3U0I6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smim6Q3U0I6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smim6Q3U0I6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim6Q3U0I6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim6Q3U0I6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Smim6Q3U0I6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smim6Q3U0I6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smim6Q3U0I6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim6Q3U0I6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smim6Q3U0I6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim6Q3U0I6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim6Q3U0I6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim6Q3U0I6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim6Q3U0I6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim6Q3U0I6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim6Q3U0I6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim6Q3U0I6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim6Q3U0I6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim6Q3U0I6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim6Q3U0I6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim6Q3U0I6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim6Q3U0I6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim6Q3U0I6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim6Q3U0I6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim6Q3U0I6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim6Q3U0I6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim6Q3U0I6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim6Q3U0I6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim6Q3U0I6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim6Q3U0I6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim6Q3U0I6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim6Q3U0I6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim6Q3U0I6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim6Q3U0I6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim6Q3U0I6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim6Q3U0I6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim6Q3U0I6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smim6Q3U0I6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim6Q3U0I6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim6Q3U0I6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smim6Q3U0I6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim6Q3U0I6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim6Q3U0I6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim6Q3U0I6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smim6Q3U0I6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smim6Q3U0I6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms