Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX08

Trmt1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1Q3TX08 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trmt1Q3TX08 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trmt1Q3TX08 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trmt1Q3TX08 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trmt1Q3TX08 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trmt1Q3TX08 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trmt1Q3TX08 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trmt1Q3TX08 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trmt1Q3TX08 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trmt1Q3TX08 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trmt1Q3TX08 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trmt1Q3TX08 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trmt1Q3TX08 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trmt1Q3TX08 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trmt1Q3TX08 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trmt1Q3TX08 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trmt1Q3TX08 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trmt1Q3TX08 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trmt1Q3TX08 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trmt1Q3TX08 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trmt1Q3TX08 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trmt1Q3TX08 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trmt1Q3TX08 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trmt1Q3TX08 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trmt1Q3TX08 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trmt1Q3TX08 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trmt1Q3TX08 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trmt1Q3TX08 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trmt1Q3TX08 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trmt1Q3TX08 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trmt1Q3TX08 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trmt1Q3TX08 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trmt1Q3TX08 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trmt1Q3TX08 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trmt1Q3TX08 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trmt1Q3TX08 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trmt1Q3TX08 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trmt1Q3TX08 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trmt1Q3TX08 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trmt1Q3TX08 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trmt1Q3TX08 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trmt1Q3TX08 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trmt1Q3TX08 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trmt1Q3TX08 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trmt1Q3TX08 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trmt1Q3TX08 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trmt1Q3TX08 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms