Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Ccdc136Q3TVA9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Ccdc136Q3TVA9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
Ccdc136Q3TVA9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Ccdc136Q3TVA9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Ccdc136Q3TVA9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Ccdc136Q3TVA9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Ccdc136Q3TVA9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ccdc136Q3TVA9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ccdc136Q3TVA9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ccdc136Q3TVA9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ccdc136Q3TVA9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ccdc136Q3TVA9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Ccdc136Q3TVA9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ccdc136Q3TVA9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ccdc136Q3TVA9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ccdc136Q3TVA9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ccdc136Q3TVA9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ccdc136Q3TVA9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ccdc136Q3TVA9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Ccdc136Q3TVA9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ccdc136Q3TVA9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Ccdc136Q3TVA9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ccdc136Q3TVA9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ccdc136Q3TVA9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ccdc136Q3TVA9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Ccdc136Q3TVA9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ccdc136Q3TVA9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ccdc136Q3TVA9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ccdc136Q3TVA9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ccdc136Q3TVA9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ccdc136Q3TVA9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ccdc136Q3TVA9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Ccdc136Q3TVA9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Ccdc136Q3TVA9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ccdc136Q3TVA9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ccdc136Q3TVA9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ccdc136Q3TVA9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ccdc136Q3TVA9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ccdc136Q3TVA9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ccdc136Q3TVA9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ccdc136Q3TVA9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Ccdc136Q3TVA9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ccdc136Q3TVA9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ccdc136Q3TVA9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ccdc136Q3TVA9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ccdc136Q3TVA9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ccdc136Q3TVA9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ccdc136Q3TVA9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ccdc136Q3TVA9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ccdc136Q3TVA9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ccdc136Q3TVA9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ccdc136Q3TVA9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ccdc136Q3TVA9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ccdc136Q3TVA9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ccdc136Q3TVA9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ccdc136Q3TVA9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ccdc136Q3TVA9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ccdc136Q3TVA9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ccdc136Q3TVA9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ccdc136Q3TVA9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ccdc136Q3TVA9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ccdc136Q3TVA9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ccdc136Q3TVA9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ccdc136Q3TVA9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ccdc136Q3TVA9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ccdc136Q3TVA9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ccdc136Q3TVA9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ccdc136Q3TVA9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ccdc136Q3TVA9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ccdc136Q3TVA9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ccdc136Q3TVA9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ccdc136Q3TVA9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ccdc136Q3TVA9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ccdc136Q3TVA9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ccdc136Q3TVA9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ccdc136Q3TVA9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ccdc136Q3TVA9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ccdc136Q3TVA9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ccdc136Q3TVA9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Ccdc136Q3TVA9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Ccdc136Q3TVA9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Ccdc136Q3TVA9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ccdc136Q3TVA9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Ccdc136Q3TVA9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Ccdc136Q3TVA9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ccdc136Q3TVA9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Ccdc136Q3TVA9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Ccdc136Q3TVA9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Ccdc136Q3TVA9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ccdc136Q3TVA9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ccdc136Q3TVA9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Ccdc136Q3TVA9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Ccdc136Q3TVA9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ccdc136Q3TVA9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ccdc136Q3TVA9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ccdc136Q3TVA9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ccdc136Q3TVA9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ccdc136Q3TVA9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ccdc136Q3TVA9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms