Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Calr4Q3TQS0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms