Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nlrx1Q3TL44 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nlrx1Q3TL44 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nlrx1Q3TL44 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nlrx1Q3TL44 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms