Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Usp39Q3TIX9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms