Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX6

Fubp3, Far upstream element (FUSE)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fubp3Q3TIX6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fubp3Q3TIX6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fubp3Q3TIX6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fubp3Q3TIX6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fubp3Q3TIX6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Fubp3Q3TIX6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fubp3Q3TIX6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fubp3Q3TIX6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fubp3Q3TIX6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fubp3Q3TIX6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fubp3Q3TIX6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fubp3Q3TIX6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fubp3Q3TIX6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fubp3Q3TIX6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fubp3Q3TIX6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fubp3Q3TIX6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fubp3Q3TIX6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Fubp3Q3TIX6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fubp3Q3TIX6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fubp3Q3TIX6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fubp3Q3TIX6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fubp3Q3TIX6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fubp3Q3TIX6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fubp3Q3TIX6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fubp3Q3TIX6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fubp3Q3TIX6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fubp3Q3TIX6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fubp3Q3TIX6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fubp3Q3TIX6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fubp3Q3TIX6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Fubp3Q3TIX6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fubp3Q3TIX6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fubp3Q3TIX6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fubp3Q3TIX6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms