Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms