Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms