Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms