Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms