Protein–RNA interactions for Protein: Q2MDG0

Rhox4d, Reproductive homeobox 4D, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox4dQ2MDG0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox4dQ2MDG0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox4dQ2MDG0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox4dQ2MDG0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox4dQ2MDG0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox4dQ2MDG0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox4dQ2MDG0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox4dQ2MDG0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox4dQ2MDG0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox4dQ2MDG0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox4dQ2MDG0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox4dQ2MDG0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox4dQ2MDG0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox4dQ2MDG0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox4dQ2MDG0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox4dQ2MDG0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox4dQ2MDG0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox4dQ2MDG0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox4dQ2MDG0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox4dQ2MDG0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox4dQ2MDG0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox4dQ2MDG0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox4dQ2MDG0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox4dQ2MDG0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox4dQ2MDG0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox4dQ2MDG0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox4dQ2MDG0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox4dQ2MDG0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox4dQ2MDG0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox4dQ2MDG0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox4dQ2MDG0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox4dQ2MDG0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox4dQ2MDG0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox4dQ2MDG0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox4dQ2MDG0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox4dQ2MDG0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox4dQ2MDG0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox4dQ2MDG0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox4dQ2MDG0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox4dQ2MDG0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox4dQ2MDG0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms