Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim71Q1PSW8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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