Protein–RNA interactions for Protein: Q1HDU4

Arhgap9, ArhGAP9, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap9Q1HDU4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arhgap9Q1HDU4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Arhgap9Q1HDU4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Arhgap9Q1HDU4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Arhgap9Q1HDU4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Arhgap9Q1HDU4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Arhgap9Q1HDU4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arhgap9Q1HDU4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arhgap9Q1HDU4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arhgap9Q1HDU4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arhgap9Q1HDU4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arhgap9Q1HDU4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms