Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGM9

Rtel1, Regulator of telomere elongation helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtel1Q0VGM9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rtel1Q0VGM9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms