Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc162pQ0VG85 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms