Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp2b3Q0VF55 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms