Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Samd12Q0VE29 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd12Q0VE29 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd12Q0VE29 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd12Q0VE29 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd12Q0VE29 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd12Q0VE29 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd12Q0VE29 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd12Q0VE29 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd12Q0VE29 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd12Q0VE29 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd12Q0VE29 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd12Q0VE29 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd12Q0VE29 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd12Q0VE29 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd12Q0VE29 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd12Q0VE29 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd12Q0VE29 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd12Q0VE29 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd12Q0VE29 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd12Q0VE29 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd12Q0VE29 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd12Q0VE29 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd12Q0VE29 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd12Q0VE29 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd12Q0VE29 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd12Q0VE29 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd12Q0VE29 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd12Q0VE29 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd12Q0VE29 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd12Q0VE29 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd12Q0VE29 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd12Q0VE29 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms