Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem52bQ0VBF2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem52bQ0VBF2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem52bQ0VBF2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem52bQ0VBF2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem52bQ0VBF2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem52bQ0VBF2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem52bQ0VBF2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem52bQ0VBF2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem52bQ0VBF2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem52bQ0VBF2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem52bQ0VBF2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem52bQ0VBF2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem52bQ0VBF2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem52bQ0VBF2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem52bQ0VBF2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem52bQ0VBF2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem52bQ0VBF2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem52bQ0VBF2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem52bQ0VBF2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem52bQ0VBF2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem52bQ0VBF2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem52bQ0VBF2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem52bQ0VBF2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem52bQ0VBF2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem52bQ0VBF2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem52bQ0VBF2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmem52bQ0VBF2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem52bQ0VBF2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem52bQ0VBF2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem52bQ0VBF2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem52bQ0VBF2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem52bQ0VBF2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms