Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms