Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V2

Sobp, Sine oculis-binding protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SobpQ0P5V2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SobpQ0P5V2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SobpQ0P5V2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SobpQ0P5V2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SobpQ0P5V2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SobpQ0P5V2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SobpQ0P5V2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SobpQ0P5V2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SobpQ0P5V2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SobpQ0P5V2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SobpQ0P5V2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SobpQ0P5V2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SobpQ0P5V2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SobpQ0P5V2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SobpQ0P5V2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SobpQ0P5V2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SobpQ0P5V2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SobpQ0P5V2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SobpQ0P5V2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SobpQ0P5V2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SobpQ0P5V2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SobpQ0P5V2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SobpQ0P5V2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SobpQ0P5V2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SobpQ0P5V2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SobpQ0P5V2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SobpQ0P5V2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SobpQ0P5V2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SobpQ0P5V2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SobpQ0P5V2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SobpQ0P5V2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SobpQ0P5V2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SobpQ0P5V2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SobpQ0P5V2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SobpQ0P5V2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SobpQ0P5V2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SobpQ0P5V2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SobpQ0P5V2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SobpQ0P5V2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SobpQ0P5V2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SobpQ0P5V2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SobpQ0P5V2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SobpQ0P5V2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SobpQ0P5V2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SobpQ0P5V2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SobpQ0P5V2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SobpQ0P5V2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SobpQ0P5V2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SobpQ0P5V2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SobpQ0P5V2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SobpQ0P5V2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SobpQ0P5V2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SobpQ0P5V2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SobpQ0P5V2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SobpQ0P5V2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SobpQ0P5V2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SobpQ0P5V2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SobpQ0P5V2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SobpQ0P5V2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SobpQ0P5V2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SobpQ0P5V2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SobpQ0P5V2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SobpQ0P5V2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SobpQ0P5V2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SobpQ0P5V2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SobpQ0P5V2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SobpQ0P5V2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SobpQ0P5V2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SobpQ0P5V2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SobpQ0P5V2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SobpQ0P5V2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SobpQ0P5V2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SobpQ0P5V2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SobpQ0P5V2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SobpQ0P5V2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SobpQ0P5V2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SobpQ0P5V2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SobpQ0P5V2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SobpQ0P5V2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SobpQ0P5V2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SobpQ0P5V2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SobpQ0P5V2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SobpQ0P5V2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SobpQ0P5V2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SobpQ0P5V2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SobpQ0P5V2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SobpQ0P5V2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SobpQ0P5V2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SobpQ0P5V2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SobpQ0P5V2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SobpQ0P5V2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SobpQ0P5V2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SobpQ0P5V2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SobpQ0P5V2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SobpQ0P5V2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SobpQ0P5V2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SobpQ0P5V2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SobpQ0P5V2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SobpQ0P5V2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SobpQ0P5V2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms