Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Neurl1bQ0MW30 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Neurl1bQ0MW30 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Neurl1bQ0MW30 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Neurl1bQ0MW30 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Neurl1bQ0MW30 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Neurl1bQ0MW30 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Neurl1bQ0MW30 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Neurl1bQ0MW30 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Neurl1bQ0MW30 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Neurl1bQ0MW30 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Neurl1bQ0MW30 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Neurl1bQ0MW30 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Neurl1bQ0MW30 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Neurl1bQ0MW30 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Neurl1bQ0MW30 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Neurl1bQ0MW30 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Neurl1bQ0MW30 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Neurl1bQ0MW30 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Neurl1bQ0MW30 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Neurl1bQ0MW30 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Neurl1bQ0MW30 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Neurl1bQ0MW30 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Neurl1bQ0MW30 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Neurl1bQ0MW30 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Neurl1bQ0MW30 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Neurl1bQ0MW30 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Neurl1bQ0MW30 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Neurl1bQ0MW30 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Neurl1bQ0MW30 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Neurl1bQ0MW30 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Neurl1bQ0MW30 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Neurl1bQ0MW30 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Neurl1bQ0MW30 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Neurl1bQ0MW30 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Neurl1bQ0MW30 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Neurl1bQ0MW30 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Neurl1bQ0MW30 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Neurl1bQ0MW30 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Neurl1bQ0MW30 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Neurl1bQ0MW30 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Neurl1bQ0MW30 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Neurl1bQ0MW30 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Neurl1bQ0MW30 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Neurl1bQ0MW30 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Neurl1bQ0MW30 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Neurl1bQ0MW30 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms