Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ubxn2bQ0KL01 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ubxn2bQ0KL01 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ubxn2bQ0KL01 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ubxn2bQ0KL01 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ubxn2bQ0KL01 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ubxn2bQ0KL01 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ubxn2bQ0KL01 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ubxn2bQ0KL01 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ubxn2bQ0KL01 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ubxn2bQ0KL01 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ubxn2bQ0KL01 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ubxn2bQ0KL01 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ubxn2bQ0KL01 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ubxn2bQ0KL01 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ubxn2bQ0KL01 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ubxn2bQ0KL01 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ubxn2bQ0KL01 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ubxn2bQ0KL01 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ubxn2bQ0KL01 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ubxn2bQ0KL01 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ubxn2bQ0KL01 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ubxn2bQ0KL01 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ubxn2bQ0KL01 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ubxn2bQ0KL01 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ubxn2bQ0KL01 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ubxn2bQ0KL01 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ubxn2bQ0KL01 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ubxn2bQ0KL01 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ubxn2bQ0KL01 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn2bQ0KL01 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn2bQ0KL01 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn2bQ0KL01 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn2bQ0KL01 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn2bQ0KL01 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn2bQ0KL01 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn2bQ0KL01 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn2bQ0KL01 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn2bQ0KL01 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn2bQ0KL01 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn2bQ0KL01 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ubxn2bQ0KL01 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ubxn2bQ0KL01 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ubxn2bQ0KL01 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ubxn2bQ0KL01 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ubxn2bQ0KL01 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ubxn2bQ0KL01 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubxn2bQ0KL01 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubxn2bQ0KL01 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubxn2bQ0KL01 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubxn2bQ0KL01 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubxn2bQ0KL01 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubxn2bQ0KL01 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubxn2bQ0KL01 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubxn2bQ0KL01 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubxn2bQ0KL01 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubxn2bQ0KL01 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ubxn2bQ0KL01 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ubxn2bQ0KL01 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ubxn2bQ0KL01 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ubxn2bQ0KL01 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ubxn2bQ0KL01 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn2bQ0KL01 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn2bQ0KL01 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn2bQ0KL01 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn2bQ0KL01 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn2bQ0KL01 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn2bQ0KL01 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn2bQ0KL01 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn2bQ0KL01 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn2bQ0KL01 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ubxn2bQ0KL01 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ubxn2bQ0KL01 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms