Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kndc1Q0KK55 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kndc1Q0KK55 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kndc1Q0KK55 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kndc1Q0KK55 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kndc1Q0KK55 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kndc1Q0KK55 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kndc1Q0KK55 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Kndc1Q0KK55 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kndc1Q0KK55 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kndc1Q0KK55 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kndc1Q0KK55 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kndc1Q0KK55 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kndc1Q0KK55 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Kndc1Q0KK55 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kndc1Q0KK55 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kndc1Q0KK55 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Kndc1Q0KK55 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kndc1Q0KK55 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kndc1Q0KK55 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kndc1Q0KK55 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kndc1Q0KK55 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kndc1Q0KK55 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kndc1Q0KK55 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kndc1Q0KK55 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kndc1Q0KK55 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Kndc1Q0KK55 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kndc1Q0KK55 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kndc1Q0KK55 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kndc1Q0KK55 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kndc1Q0KK55 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kndc1Q0KK55 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kndc1Q0KK55 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kndc1Q0KK55 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kndc1Q0KK55 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kndc1Q0KK55 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kndc1Q0KK55 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Kndc1Q0KK55 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kndc1Q0KK55 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kndc1Q0KK55 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kndc1Q0KK55 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kndc1Q0KK55 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kndc1Q0KK55 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Kndc1Q0KK55 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kndc1Q0KK55 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kndc1Q0KK55 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kndc1Q0KK55 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kndc1Q0KK55 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kndc1Q0KK55 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms