Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cnnm1Q0GA42 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cnnm1Q0GA42 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cnnm1Q0GA42 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cnnm1Q0GA42 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cnnm1Q0GA42 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cnnm1Q0GA42 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cnnm1Q0GA42 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cnnm1Q0GA42 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cnnm1Q0GA42 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cnnm1Q0GA42 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cnnm1Q0GA42 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cnnm1Q0GA42 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cnnm1Q0GA42 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnnm1Q0GA42 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnnm1Q0GA42 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnnm1Q0GA42 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnnm1Q0GA42 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnnm1Q0GA42 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnnm1Q0GA42 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnnm1Q0GA42 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnnm1Q0GA42 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnnm1Q0GA42 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnnm1Q0GA42 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnnm1Q0GA42 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnnm1Q0GA42 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnnm1Q0GA42 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnnm1Q0GA42 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnnm1Q0GA42 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnnm1Q0GA42 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnnm1Q0GA42 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnnm1Q0GA42 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnnm1Q0GA42 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnnm1Q0GA42 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnnm1Q0GA42 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnnm1Q0GA42 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnnm1Q0GA42 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnnm1Q0GA42 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnnm1Q0GA42 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms