Protein–RNA interactions for Protein: Q08775

Runx2, Runt-related transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx2Q08775 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Runx2Q08775 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms