Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms