Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms