Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gdf3Q07104 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms