Protein–RNA interactions for Protein: Q06890

Clu, Clusterin, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluQ06890 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CluQ06890 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CluQ06890 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CluQ06890 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CluQ06890 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CluQ06890 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CluQ06890 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CluQ06890 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CluQ06890 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CluQ06890 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CluQ06890 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CluQ06890 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CluQ06890 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CluQ06890 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CluQ06890 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CluQ06890 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CluQ06890 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CluQ06890 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CluQ06890 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CluQ06890 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CluQ06890 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CluQ06890 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CluQ06890 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CluQ06890 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CluQ06890 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CluQ06890 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CluQ06890 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CluQ06890 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CluQ06890 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CluQ06890 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CluQ06890 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CluQ06890 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CluQ06890 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CluQ06890 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CluQ06890 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CluQ06890 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CluQ06890 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CluQ06890 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CluQ06890 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CluQ06890 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CluQ06890 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CluQ06890 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CluQ06890 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CluQ06890 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CluQ06890 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CluQ06890 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CluQ06890 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CluQ06890 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CluQ06890 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CluQ06890 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CluQ06890 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CluQ06890 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CluQ06890 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CluQ06890 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CluQ06890 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CluQ06890 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CluQ06890 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CluQ06890 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CluQ06890 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CluQ06890 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CluQ06890 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CluQ06890 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CluQ06890 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CluQ06890 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CluQ06890 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CluQ06890 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CluQ06890 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CluQ06890 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CluQ06890 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CluQ06890 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CluQ06890 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CluQ06890 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CluQ06890 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CluQ06890 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CluQ06890 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CluQ06890 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CluQ06890 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CluQ06890 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CluQ06890 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CluQ06890 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CluQ06890 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CluQ06890 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CluQ06890 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CluQ06890 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CluQ06890 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CluQ06890 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CluQ06890 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CluQ06890 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CluQ06890 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CluQ06890 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CluQ06890 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CluQ06890 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CluQ06890 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CluQ06890 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CluQ06890 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CluQ06890 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CluQ06890 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CluQ06890 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CluQ06890 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CluQ06890 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms