Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Fmn1Q05860 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Fmn1Q05860 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Fmn1Q05860 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Fmn1Q05860 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Fmn1Q05860 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Fmn1Q05860 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Fmn1Q05860 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Fmn1Q05860 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Fmn1Q05860 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Fmn1Q05860 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Fmn1Q05860 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Fmn1Q05860 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Fmn1Q05860 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Fmn1Q05860 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Fmn1Q05860 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Fmn1Q05860 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Fmn1Q05860 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Fmn1Q05860 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Fmn1Q05860 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Fmn1Q05860 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Fmn1Q05860 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Fmn1Q05860 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Fmn1Q05860 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Fmn1Q05860 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Fmn1Q05860 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Fmn1Q05860 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Fmn1Q05860 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Fmn1Q05860 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Fmn1Q05860 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Fmn1Q05860 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Fmn1Q05860 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Fmn1Q05860 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Fmn1Q05860 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Fmn1Q05860 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Fmn1Q05860 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Fmn1Q05860 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Fmn1Q05860 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Fmn1Q05860 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Fmn1Q05860 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Fmn1Q05860 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Fmn1Q05860 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Fmn1Q05860 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Fmn1Q05860 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Fmn1Q05860 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Fmn1Q05860 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Fmn1Q05860 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Fmn1Q05860 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Fmn1Q05860 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Fmn1Q05860 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Fmn1Q05860 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Fmn1Q05860 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Fmn1Q05860 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Fmn1Q05860 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Fmn1Q05860 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Fmn1Q05860 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Fmn1Q05860 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Fmn1Q05860 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Fmn1Q05860 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Fmn1Q05860 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Fmn1Q05860 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Fmn1Q05860 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Fmn1Q05860 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Fmn1Q05860 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Fmn1Q05860 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Fmn1Q05860 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Fmn1Q05860 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Fmn1Q05860 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Fmn1Q05860 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Fmn1Q05860 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Fmn1Q05860 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Fmn1Q05860 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Fmn1Q05860 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Fmn1Q05860 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Fmn1Q05860 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Fmn1Q05860 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Fmn1Q05860 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Fmn1Q05860 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Fmn1Q05860 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Fmn1Q05860 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Fmn1Q05860 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
Fmn1Q05860 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Fmn1Q05860 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Fmn1Q05860 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Fmn1Q05860 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Fmn1Q05860 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Fmn1Q05860 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Fmn1Q05860 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Fmn1Q05860 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Fmn1Q05860 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Fmn1Q05860 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Fmn1Q05860 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Fmn1Q05860 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Fmn1Q05860 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Fmn1Q05860 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Fmn1Q05860 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Fmn1Q05860 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Fmn1Q05860 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Fmn1Q05860 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Fmn1Q05860 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms