Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rcn1Q05186 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rcn1Q05186 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rcn1Q05186 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rcn1Q05186 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rcn1Q05186 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rcn1Q05186 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rcn1Q05186 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rcn1Q05186 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rcn1Q05186 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rcn1Q05186 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rcn1Q05186 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rcn1Q05186 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rcn1Q05186 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rcn1Q05186 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rcn1Q05186 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rcn1Q05186 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rcn1Q05186 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rcn1Q05186 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rcn1Q05186 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rcn1Q05186 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rcn1Q05186 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rcn1Q05186 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rcn1Q05186 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rcn1Q05186 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rcn1Q05186 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rcn1Q05186 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rcn1Q05186 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rcn1Q05186 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rcn1Q05186 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rcn1Q05186 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rcn1Q05186 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rcn1Q05186 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rcn1Q05186 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rcn1Q05186 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rcn1Q05186 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rcn1Q05186 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms