Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Top1Q04750 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Top1Q04750 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Top1Q04750 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Top1Q04750 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Top1Q04750 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Top1Q04750 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Top1Q04750 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Top1Q04750 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Top1Q04750 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Top1Q04750 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top1Q04750 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top1Q04750 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top1Q04750 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top1Q04750 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top1Q04750 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top1Q04750 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top1Q04750 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Top1Q04750 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top1Q04750 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top1Q04750 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top1Q04750 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top1Q04750 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top1Q04750 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top1Q04750 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Top1Q04750 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Top1Q04750 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Top1Q04750 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Top1Q04750 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Top1Q04750 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Top1Q04750 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Top1Q04750 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Top1Q04750 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Top1Q04750 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Top1Q04750 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Top1Q04750 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top1Q04750 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top1Q04750 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top1Q04750 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms