Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msx2Q03358 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms