Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddr1Q03146 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms